В Казахстане среди семечковых пород первое место по количеству деревьев и выходу продукции занимает яблоня. Большая часть ее насаждений и диких зарослей сосредоточена на юге и юго-востоке, как, впрочем, всех других видов садовых и ягодных растений. Основным сортом является Апорт, деревья которого подвержены наибольшему количеству заболеваний.

Самым опасным заболеванием культурной яблони являются термические повреждения коры. Они известны по всему юго-востоку республики, то есть в основном районе садоводства - алма-атинской плодовой зоне. Ослабленные и поврежденные части стволов и ветвей в садах старше 20 лет поражаются черным раком, ускоряющим гибель деревьев. Деревья моложе 20 лет не поражаются этим заболеванием.

Вредоносна в алма-атинской зоне садоводства и мучнистая роса, особенно на деревьях сорта Ренет Бурхарда.

Повсеместно очень сильно болеют паршой дикие заросли яблони. По всей северной половине Казахстана деревья культурных сортов в тяжелой форме поражаются этим заболеванием. До недавнего времени в алма-атинской плодовой зоне парша не отмечалась на деревьях местных культурных районированных сортов. Но несколько лет назад болезнь была обнаружена севернее Алма-Аты в саду, заложенном посадочным материалом, привезенным из Брянской области. Заболевание поражает как деревья заверенных сортов, так и местных, в том числе Апорт и Ренет Бурхарда.

Гниль древесины распространена как вторичное заболевание повсеместно на старых поврежденных морозами и солнечными ожогами деревьях.

Монилиоз, являющийся одним из опасных заболеваний яблони в районах садоводства Европейской части Советского Союза, чрезвычайно редко отмечался в алма-атинской плодовой зоне на единичных яблоках в серьге в подвале.